《易林》中的儒家思想，也表现在对西汉盛行的阴阳灾异学说的吸收上。西汉学者董仲舒出于构建新儒学的需要，将阴阳、五行两大学说并纳入了儒学的系统，“以 《春秋》灾异之变推阴阳所以错行”,从而以《春秋》公羊学为基础，以阴阳、五行理论为骨架，建构了天人感应的目的论。《易林》受董仲舒天人感应目的论的影响，并吸收了西汉武帝以来太一崇拜的思想，构建了以太一为本、以阴阳五行为用的宇宙观。如:

《大有之复》:“火之井谷，杨芒生角，犯历天户，窥观太极，登上玉床，家易六公。”

《家人之需》:“主有圣德，上配太极。皇灵建中，授我以福。”

《大畜之大壮》:“太乙置酒，乐正起舞。万福攸同，可以安处，保我覯齿。”

《屯之随》:“太乙驾骝，从天上来。征我叔季，封为鲁侯，无有凶忧。”

《恒之复》:“阿衡服箱，太乙载行。迩时历舍，所求吉昌。’

这五条林辞，反复出现了“太极”“太乙”概念，说明战国秦汉间在哲学上作为宇宙本根的“太一”，发展至两汉之际已经成为人们的普遍信仰，尤其是我们通过“太乙置酒”“太乙驾骝”等词句，可以看出在汉代人的思想观念中，“太乙”更具有了人格神的意味，这体现了太一概念在《周易》经学阴阳灾异化后的一个发展趋向。“太一”之居所太微、紫宫,也在《易林》中频频出现，为其阴阳灾异思想服务，如:

《乾之丰》:“太微帝室，黄帝所值。藩屏固卫，不可得入，常安无患。”

《大过之益》:“太微复明，说升傅岩，乃称高宗。’

《既济之蒙》:“太山上奔，变见太微。陈吾废忽，作为祸患。”

《坤之观》:“北辰紫官，衣冠立中。含和建德，常受天福。”

《涣之否》:“天门帝室，黄帝所直。藩屏周卫，不可得入。常安长在，终无祸患。”

这都说明作者接受了当时在哲学上以“太一”为宇宙本根、在宗教文化上以“太一”为最高神的思想。很明显，这种宇宙论近似于宗教，具有很大的空想性质,它不可能完全解释现实生活中林林总总的现象，所以作者在撰写林辞解释自然、社会和人生现象时，更多凭借的是阴阳学说。作者吸收了《系辞》“一阴一阳之谓道”的观点，认为天下事物之变化，是阴阳二气相互推荡、相互消长的结果，如:

《大有之临》:“阴衰老极，阳建其德。离载阳光，天下昭明。

《剥之家人》:“岁暮花落，阳入阴室。万物伏匿，藏不可得。”

《大过之乾》:“日在北陆，阴蔽阳目。万物空虛，不见长育。”

《谦之渐》:“长夜短日，阴为阳贼。万物空枯，藏于北陆。”

由于阳气是催动事物生长、发展的力量,而阴气是使事物衰老、死亡的力量,所以作者产生了一-定的尊阳卑阴的观念，并以之解释自然、政治现象。如:

《渙之升》:“生有阴孽，制家非阳。遂受还作，张氏易休，忧祸重凶。”

《离之观》:“阴蔽其阳，日暗不明，君忧其国。求骗得黄，驹犊从行。’

《颐之噬嗑》:“随阳转行，不失其常。君安于乡，国无咎殃。”

《剥之小过》:“阳不违德，高山多泽。颜子逐兔，未有所得。”

《艮之随》:“阴升阳伏，舜失其室。元元赤子，相馁不食。”

并且，作者认为，自然、社会上丑恶的事物或现象，往往是阴气或阳气过重的缘故;阴阳不调，事物就不会处在最佳状态，也就会有灾异产生。如:

《艮之晋》:“阴生獐鹿，鼠舞鬼谷。灵龟陆处，釜甑草土。人知败国，桀乱无绪。’

《震之解》:“胡俗戎狄，太阴所积。涸洌冱寒，君子不存。”

《乾之屯》:“阳孤亢极，多所恨惑。车倾盖亡，身常忧惶。乃得其愿，雌雄相从。”

《泰之颐》:“童女无室，未有配合。阴阳不和，空坐独宿。”

《需之小畜》:“任宿独居，寡处无夫。阴阳失志，为人仆使。”

《大过之无妄》:“风怒漂木，女惑生疾。阳失其服，阴孽为贼。”

《同人之损》:“梅李冬实，国多寇贼。乱扰并作，王不能制。”

所以，作者所推崇的阴阳二气之关系，就是阴阳有序、和谐统一，这样世界万物才能达到最佳的状态，天下才会太平，祥瑞才会出现，事业才能成功。如:

《坤之诟》:“伯虎仲熊，德义洵美。使布五谷，阴阳顺序。”

《师之解》:“王德五材，和合四时。阴阳顺序，国无咎灾。”

《履之蹇》:“太仓积谷，天下饶食。阴阳调和，年岁时熟。’”

《泰之大畜》:“长生以时，长柱根本。阴阳相和，岁乐无忧。”

《大有之旅》:“麒麟凤凰，善政得祥。阴阳和调，国无灾殃。’

《谦之大有》:“天地配享，六位光明，阴阳顺序，以成厥功。”

可以说，《易林》作者的阴阳二气说，是西汉以董仲舒为代表的阴阳灾异学说在易学上的一种具体运用，其最终还是归本于儒家的仁德政治，在一定程度上是为儒家政治提供理论依据服务的。